Le Shom dispose d'une école basée à Brest sur le site du Bergot. Cette école définit, assure et contrôle la formation de personnels civils et militaires spécialistes en hydrographie, cartographie marine et océanographie ainsi que leur perfectionnement. Elle contribue à la diffusion des connaissances générales, scientifiques et techniques qui interviennent dans ces domaines.

Placée sous l'autorité du directeur général du Shom, l'école assure la formation initiale et les formations de spécialisation du personnel civil et militaire du Shom.

Elle contribue à la formation, dans le domaine de l'hydrographie, de la cartographie marine et de l'océanographie :

• des élèves ingénieurs de l'Ecole nationale supérieure des techniques avancées Bretagne (ENSTA Bretagne) ;

• de personnel civil ou militaire de l'Etat ou de ses établissements publics ;

• de personnel étranger civil ou militaire.

L'école peut également organiser des sessions de formation dans les domaines de compétence du Shom, pour d'autres catégories de personnel.